通过项目合作，国家中成药工程技术研究中心与国内顶级中药学领域的专家建立了密切的联系，为中心的发展出谋划策。 

王永炎    中国工程院院士，国家中成药工程技术研究中心顾问

张伯礼    中国工程院院士、医药卫生学部主任，中国医学科学院学部委员，天津中医药大学名誉校长，中国中医科学院名誉院长，“重大新药创制”科技重大专项技术副总师，国家重点学科中医内科学科带头人，国家中成药工程技术研究中心专家委员会组长

黄璐琦    中国工程院院士，中国中医科学院学部委员，中国中医科学院院长、研究生院院长，国家中医药管理局副局长

陈世林    中国中医科学院中药研究所所长、首席研究员、世界卫生组织传统医学中心主任

叶祖光    中国中医科学院首席研究员，973中药项目首席科学家，中药药理专家，研究员、博士生导师

肖小河    全军中药研究所所长&中西医结合肝病中心主任，博士，研究员，博士生导师，国家中医药管理局临床中药学重点学科带头人、国家临床重点建设专科负责人

屠鹏飞    北京大学药学院教授，博士生导师，国家杰出青年科学基金获得者、国家科技进步奖二等奖获得者

路金才    沈阳药科大学副校长，博士生导师

孟宪生    辽宁中医药大学药学院教授，博士生导师